自分用のメモ（間違ってても責任は取らない）

結論
tracknumberは何も考えずに全部1でよかった
Importしたい音声に対しての番号だったっぽい

remuxer -i "元映像" -i "メイン音声"?1:handler=main -i "副音声"?1:handler=audiocommentary -o "出力先"

おまけ
何らかの事情でFAW化した音声同士で結合したいとき
WAVSource()+WavSource()かいてavs2wav→fawcl

おわり